En el siglo XIV, para completar su proyecto de monasterio-panteón de la dinastía, el rey Pedro III el Ceremonioso rodeó el monasterio de las murallas defensivas que le han dado definitivamente su aspecto de fortaleza.
- Tienen un perímetro de 608 metros, más o menos cuadrado, que va siguiendo bastante ceñidamente las construcciones monásticas. La altura es de 11 metros y el grosor de 2.
- Cabe admirar las dos torres que flanquean la puerta real, único acceso al recinto (más tarde se abrió la puerta de la iglesia). Contamos en total 13 torres: las 2 torres reales, la torre del zapatero, la torre del cementerio (medio en ruinas), la torre de las hostias o de la sacristía, la torre de los locos o de la infermería, la torre de san Esteban, la torre de las armas, la torre del rincón o de las casas nuevas, una torre ahora inexistente en el lugar donde se encontraban las letrinas del dormitorio, la torre de los baños, la torre del aceite y la torre del prior.